O IFMT é uma instituição pública, portanto, todos os cursos ofertados são gratuitos. São oferecidos cursos de Nível Médio e Superior além de Formação Inicial e Continuada. Para estudar no IFMT é preciso passar por um processo seletivo. Os processos seletivos são abertos geralmente no segundo semestre de cada ano e os pré-requisitos sempre constam nos editais que são divulgados através de seu site. Atualmente são ofertados os seguintes cursos:
NÍVEL SUPERIOR
Licenciatura em Ciências da Natureza (8 semestres)
Tecnologia em Análise e Desenvolvimento de Sistema (6 semestres)
Turno: Noturno (19h às 22h30)
NÍVEL MÉDIO INTEGRADO
Técnico em Alimentos Integrado ao Nível Médio (3 anos)*
Técnico em Química Integrado ao Nível Médio (3 anos)*
Técnico em Secretariado Integrado ao Nível Médio (3 anos)
Turno: Matutino das 07h às 12h30
Técnico em Informática Integrado ao Nível Médio (3 anos)*
Turno: Vespertino das 13h às 18h30
*Apesar dos cursos de Ensino Médio Integrado ocorrerem em turnos definidos, para ajuste de carga horária, dentro dos 3 anos previstos, algumas disciplinas são cursadas no contraturno.
NÍVEL MÉDIO INTEGRADO - PROEJA
Técnico em Administração Integrado ao Nível Médio - Proeja (3 anos)
Turno: Noturno das 19h às 22h30
NÍVEL MÉDIO SUBSEQUENTE
Técnico em Química Subsequente ao Nível Médio (3 semestres)
Turno: Noturno das 19h às 22h30